Protein–RNA interactions for Protein: P25785

Timp2, Metalloproteinase inhibitor 2, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp2P25785 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timp2P25785 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timp2P25785 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timp2P25785 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timp2P25785 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timp2P25785 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timp2P25785 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timp2P25785 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timp2P25785 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Timp2P25785 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Timp2P25785 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp2P25785 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timp2P25785 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timp2P25785 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp2P25785 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp2P25785 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp2P25785 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp2P25785 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Timp2P25785 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp2P25785 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp2P25785 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Timp2P25785 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp2P25785 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp2P25785 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp2P25785 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp2P25785 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp2P25785 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp2P25785 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Timp2P25785 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms