Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Eif3aP23116 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Eif3aP23116 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Eif3aP23116 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Eif3aP23116 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Eif3aP23116 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Eif3aP23116 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms