Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Abcb4P21440 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcb4P21440 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcb4P21440 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcb4P21440 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Abcb4P21440 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms