Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VimP20152 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VimP20152 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VimP20152 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VimP20152 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VimP20152 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VimP20152 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VimP20152 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VimP20152 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VimP20152 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VimP20152 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VimP20152 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VimP20152 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VimP20152 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VimP20152 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VimP20152 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VimP20152 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VimP20152 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VimP20152 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VimP20152 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VimP20152 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VimP20152 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VimP20152 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VimP20152 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VimP20152 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VimP20152 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VimP20152 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VimP20152 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VimP20152 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VimP20152 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VimP20152 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VimP20152 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VimP20152 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VimP20152 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VimP20152 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VimP20152 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VimP20152 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VimP20152 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VimP20152 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VimP20152 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VimP20152 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VimP20152 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VimP20152 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VimP20152 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VimP20152 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VimP20152 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VimP20152 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VimP20152 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VimP20152 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VimP20152 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VimP20152 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VimP20152 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VimP20152 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VimP20152 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VimP20152 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VimP20152 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VimP20152 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VimP20152 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VimP20152 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VimP20152 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VimP20152 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VimP20152 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VimP20152 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VimP20152 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VimP20152 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VimP20152 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VimP20152 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VimP20152 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VimP20152 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VimP20152 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VimP20152 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VimP20152 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VimP20152 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VimP20152 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VimP20152 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VimP20152 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VimP20152 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VimP20152 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VimP20152 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VimP20152 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VimP20152 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VimP20152 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VimP20152 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VimP20152 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VimP20152 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VimP20152 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VimP20152 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VimP20152 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VimP20152 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VimP20152 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VimP20152 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VimP20152 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VimP20152 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VimP20152 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VimP20152 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VimP20152 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VimP20152 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VimP20152 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VimP20152 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VimP20152 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms