Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NefhP19246 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NefhP19246 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NefhP19246 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NefhP19246 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefhP19246 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NefhP19246 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefhP19246 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefhP19246 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NefhP19246 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NefhP19246 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefhP19246 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NefhP19246 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefhP19246 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefhP19246 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NefhP19246 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NefhP19246 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NefhP19246 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefhP19246 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NefhP19246 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefhP19246 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NefhP19246 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefhP19246 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefhP19246 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefhP19246 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NefhP19246 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefhP19246 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NefhP19246 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefhP19246 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NefhP19246 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NefhP19246 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NefhP19246 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NefhP19246 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NefhP19246 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NefhP19246 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NefhP19246 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefhP19246 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefhP19246 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NefhP19246 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefhP19246 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefhP19246 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NefhP19246 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefhP19246 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefhP19246 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefhP19246 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefhP19246 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefhP19246 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NefhP19246 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefhP19246 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefhP19246 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NefhP19246 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NefhP19246 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NefhP19246 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NefhP19246 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NefhP19246 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NefhP19246 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NefhP19246 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefhP19246 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefhP19246 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefhP19246 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NefhP19246 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NefhP19246 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefhP19246 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NefhP19246 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NefhP19246 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefhP19246 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefhP19246 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefhP19246 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefhP19246 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefhP19246 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefhP19246 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NefhP19246 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefhP19246 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefhP19246 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefhP19246 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefhP19246 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefhP19246 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefhP19246 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NefhP19246 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefhP19246 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NefhP19246 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefhP19246 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NefhP19246 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefhP19246 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NefhP19246 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefhP19246 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefhP19246 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NefhP19246 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NefhP19246 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefhP19246 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefhP19246 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefhP19246 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NefhP19246 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefhP19246 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefhP19246 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NefhP19246 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NefhP19246 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefhP19246 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefhP19246 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefhP19246 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms