Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tnnc1P19123 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnnc1P19123 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnnc1P19123 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnnc1P19123 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnnc1P19123 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms