Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P18533 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P18533 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P18533 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P18533 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P18533 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P18533 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P18533 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P18533 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P18533 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P18533 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P18533 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
P18533 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P18533 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P18533 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P18533 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P18533 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P18533 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P18533 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P18533 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P18533 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
P18533 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18533 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P18533 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P18533 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P18533 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
P18533 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P18533 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P18533 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P18533 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P18533 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
P18533 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P18533 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P18533 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P18533 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P18533 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
P18533 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P18533 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P18533 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P18533 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P18533 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P18533 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P18533 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P18533 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P18533 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P18533 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
P18533 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P18533 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P18533 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P18533 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P18533 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P18533 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P18533 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P18533 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P18533 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P18533 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P18533 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
P18533 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P18533 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P18533 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P18533 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P18533 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P18533 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P18533 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P18533 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P18533 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P18533 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18533 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18533 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18533 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P18533 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P18533 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P18533 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P18533 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P18533 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P18533 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
P18533 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P18533 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P18533 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P18533 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P18533 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P18533 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
P18533 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P18533 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
P18533 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18533 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18533 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18533 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18533 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P18533 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P18533 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P18533 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms