Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
P18532 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
P18532 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P18532 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P18532 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P18532 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P18532 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P18532 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P18532 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P18532 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P18532 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
P18532 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P18532 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P18532 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P18532 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P18532 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P18532 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P18532 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P18532 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P18532 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P18532 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P18532 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P18532 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P18532 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P18532 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P18532 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P18532 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P18532 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18532 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18532 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18532 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18532 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18532 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P18532 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P18532 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
P18532 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
P18532 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P18532 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P18532 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P18532 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P18532 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P18532 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P18532 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
P18532 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P18532 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P18532 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P18532 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P18532 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P18532 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P18532 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P18532 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P18532 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P18532 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P18532 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P18532 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P18532 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P18532 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
P18532 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P18532 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
P18532 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P18532 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P18532 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P18532 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P18532 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P18532 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P18532 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P18532 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P18532 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P18532 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P18532 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P18532 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P18532 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18532 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18532 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18532 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18532 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18532 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18532 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18532 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P18532 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P18532 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P18532 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18532 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18532 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18532 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18532 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18532 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18532 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18532 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P18532 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18532 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18532 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18532 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18532 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18532 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
P18532 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18532 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18532 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18532 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18532 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms