Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Defa-rs2P17534 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Defa-rs2P17534 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Defa-rs2P17534 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Defa-rs2P17534 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Defa-rs2P17534 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa-rs2P17534 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms