Protein–RNA interactions for Protein: P16294

F9, Coagulation factor IX, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P16294 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P16294 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
F9P16294 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P16294 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F9P16294 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F9P16294 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P16294 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P16294 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P16294 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F9P16294 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P16294 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P16294 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P16294 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P16294 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P16294 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F9P16294 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P16294 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P16294 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P16294 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F9P16294 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P16294 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P16294 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P16294 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P16294 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P16294 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P16294 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P16294 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
F9P16294 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F9P16294 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P16294 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P16294 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P16294 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P16294 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F9P16294 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P16294 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P16294 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P16294 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P16294 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P16294 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F9P16294 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P16294 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P16294 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P16294 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P16294 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P16294 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P16294 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F9P16294 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F9P16294 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
F9P16294 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P16294 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P16294 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
F9P16294 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P16294 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P16294 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F9P16294 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P16294 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P16294 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
F9P16294 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P16294 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P16294 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
F9P16294 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P16294 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P16294 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P16294 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
F9P16294 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P16294 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
F9P16294 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P16294 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P16294 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P16294 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P16294 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P16294 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P16294 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P16294 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P16294 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P16294 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P16294 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P16294 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
F9P16294 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P16294 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
F9P16294 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F9P16294 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P16294 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P16294 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P16294 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P16294 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P16294 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P16294 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P16294 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P16294 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P16294 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P16294 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P16294 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P16294 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P16294 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P16294 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P16294 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P16294 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P16294 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P16294 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms