Protein–RNA interactions for Protein: P15089

Cpa3, Mast cell carboxypeptidase A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa3P15089 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpa3P15089 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpa3P15089 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cpa3P15089 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpa3P15089 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cpa3P15089 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa3P15089 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa3P15089 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa3P15089 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpa3P15089 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa3P15089 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa3P15089 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa3P15089 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa3P15089 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa3P15089 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpa3P15089 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpa3P15089 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms