Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp54P14576 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srp54P14576 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54P14576 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54P14576 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srp54P14576 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srp54P14576 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp54P14576 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp54P14576 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp54P14576 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54P14576 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54P14576 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Srp54P14576 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54P14576 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp54P14576 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srp54P14576 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srp54P14576 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms