Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Tnni2P13412 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Tnni2P13412 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tnni2P13412 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Tnni2P13412 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Tnni2P13412 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,6 ms