Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cntn1P12960 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cntn1P12960 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cntn1P12960 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cntn1P12960 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms