Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tnp1P10856 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tnp1P10856 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tnp1P10856 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms