Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd7P0C872 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd7P0C872 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jmjd7P0C872 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd7P0C872 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms