Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Surf1P09925 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Surf1P09925 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Surf1P09925 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Surf1P09925 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Surf1P09925 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Surf1P09925 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Surf1P09925 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Surf1P09925 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Surf1P09925 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Surf1P09925 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Surf1P09925 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Surf1P09925 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Surf1P09925 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Surf1P09925 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Surf1P09925 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Surf1P09925 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Surf1P09925 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms