Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ifna9P09235 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ifna9P09235 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ifna9P09235 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ifna9P09235 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ifna9P09235 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms