Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax1P09084 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax1P09084 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pax1P09084 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax1P09084 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax1P09084 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax1P09084 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax1P09084 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax1P09084 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pax1P09084 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax1P09084 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax1P09084 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pax1P09084 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pax1P09084 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pax1P09084 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax1P09084 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pax1P09084 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax1P09084 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax1P09084 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax1P09084 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms