Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Egr1P08046 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Egr1P08046 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Egr1P08046 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Egr1P08046 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Egr1P08046 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Egr1P08046 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Egr1P08046 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Egr1P08046 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Egr1P08046 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Egr1P08046 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Egr1P08046 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Egr1P08046 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Egr1P08046 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Egr1P08046 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms