Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zfp1P08042 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfp1P08042 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp1P08042 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp1P08042 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp1P08042 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp1P08042 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms