Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gh1P06880 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gh1P06880 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gh1P06880 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gh1P06880 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gh1P06880 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gh1P06880 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gh1P06880 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gh1P06880 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gh1P06880 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gh1P06880 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gh1P06880 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gh1P06880 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gh1P06880 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms