Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06323 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06323 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06323 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06323 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06323 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06323 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06323 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06323 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06323 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06323 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06323 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06323 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06323 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06323 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06323 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06323 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06323 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06323 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06323 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06323 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06323 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06323 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06323 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06323 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06323 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06323 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06323 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06323 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06323 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06323 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P06323 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06323 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06323 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06323 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06323 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06323 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06323 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06323 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P06323 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06323 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06323 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06323 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06323 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06323 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06323 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06323 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06323 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06323 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06323 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06323 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06323 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06323 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06323 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06323 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06323 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06323 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06323 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06323 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06323 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06323 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06323 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06323 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06323 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06323 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06323 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06323 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06323 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06323 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06323 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06323 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06323 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06323 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06323 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06323 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06323 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P06323 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P06323 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P06323 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06323 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.7 ms