Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
P06321 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P06321 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P06321 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P06321 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P06321 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P06321 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P06321 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P06321 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P06321 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P06321 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P06321 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P06321 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P06321 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P06321 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
P06321 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P06321 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P06321 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
P06321 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P06321 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P06321 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P06321 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P06321 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P06321 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
P06321 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P06321 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P06321 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P06321 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P06321 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P06321 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P06321 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P06321 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P06321 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
P06321 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P06321 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P06321 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
P06321 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
P06321 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P06321 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P06321 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P06321 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P06321 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P06321 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P06321 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P06321 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P06321 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P06321 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P06321 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P06321 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P06321 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P06321 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P06321 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P06321 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P06321 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P06321 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
P06321 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P06321 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P06321 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
P06321 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P06321 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P06321 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P06321 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P06321 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P06321 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P06321 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P06321 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
P06321 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P06321 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P06321 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P06321 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P06321 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P06321 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P06321 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P06321 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P06321 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P06321 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P06321 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P06321 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P06321 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P06321 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P06321 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P06321 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P06321 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P06321 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P06321 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P06321 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P06321 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P06321 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P06321 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P06321 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P06321 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P06321 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P06321 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P06321 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P06321 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P06321 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P06321 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P06321 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P06321 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P06321 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms