Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01789 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01789 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01789 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01789 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01789 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01789 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P01789 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01789 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01789 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01789 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01789 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01789 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01789 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01789 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01789 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01789 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01789 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01789 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01789 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01789 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01789 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01789 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01789 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01789 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01789 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01789 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01789 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01789 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01789 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01789 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01789 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01789 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01789 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01789 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01789 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01789 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01789 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01789 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01789 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01789 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01789 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01789 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01789 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01789 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01789 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01789 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01789 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01789 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01789 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01789 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01789 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01789 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01789 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01789 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01789 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01789 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01789 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01789 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01789 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01789 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01789 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01789 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01789 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01789 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01789 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01789 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01789 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01789 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01789 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01789 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01789 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01789 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
P01789 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01789 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01789 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01789 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01789 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01789 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01789 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
P01789 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01789 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01789 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01789 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01789 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01789 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01789 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01789 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01789 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01789 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01789 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01789 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01789 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01789 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01789 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01789 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01789 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01789 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01789 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01789 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms