Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01788 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01788 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01788 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01788 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01788 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01788 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01788 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01788 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01788 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01788 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01788 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01788 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01788 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01788 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01788 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01788 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01788 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01788 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01788 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01788 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01788 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01788 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01788 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01788 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01788 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01788 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01788 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01788 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01788 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01788 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01788 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01788 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01788 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01788 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01788 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01788 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01788 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01788 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01788 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01788 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01788 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01788 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01788 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01788 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01788 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01788 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01788 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01788 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01788 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01788 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01788 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01788 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01788 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01788 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01788 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01788 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01788 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01788 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01788 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01788 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01788 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01788 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01788 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01788 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01788 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01788 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01788 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01788 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01788 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01788 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms