Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01755 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01755 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01755 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01755 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01755 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01755 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01755 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01755 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01755 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01755 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01755 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01755 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01755 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01755 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01755 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01755 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01755 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01755 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01755 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01755 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01755 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01755 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01755 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01755 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01755 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01755 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01755 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01755 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01755 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01755 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01755 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01755 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01755 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01755 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01755 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01755 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01755 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01755 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01755 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01755 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01755 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01755 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01755 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01755 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01755 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01755 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01755 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01755 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01755 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01755 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01755 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01755 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01755 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01755 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01755 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01755 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01755 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01755 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01755 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01755 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01755 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01755 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01755 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01755 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01755 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01755 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01755 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01755 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01755 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01755 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01755 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01755 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01755 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01755 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01755 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01755 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01755 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01755 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01755 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01755 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01755 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01755 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01755 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01755 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01755 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01755 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01755 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01755 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01755 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01755 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01755 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms