Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01747 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01747 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01747 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
P01747 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01747 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01747 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01747 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01747 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01747 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01747 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01747 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01747 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01747 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01747 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01747 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01747 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01747 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01747 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01747 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01747 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01747 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01747 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01747 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01747 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01747 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01747 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01747 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01747 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01747 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01747 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01747 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01747 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01747 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01747 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01747 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01747 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01747 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01747 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01747 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01747 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01747 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01747 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01747 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01747 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01747 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01747 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01747 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01747 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01747 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01747 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01747 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01747 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01747 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01747 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01747 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01747 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01747 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01747 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01747 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01747 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01747 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01747 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01747 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01747 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01747 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01747 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01747 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01747 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01747 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01747 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01747 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01747 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01747 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01747 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01747 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01747 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01747 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01747 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01747 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01747 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01747 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P01747 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01747 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms