Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01729 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01729 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01729 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01729 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01729 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01729 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01729 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01729 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01729 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01729 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01729 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01729 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01729 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01729 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01729 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01729 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01729 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01729 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01729 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01729 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01729 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01729 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01729 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01729 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01729 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01729 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01729 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01729 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01729 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01729 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01729 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01729 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01729 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01729 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01729 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01729 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01729 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01729 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01729 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01729 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01729 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01729 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01729 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01729 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01729 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01729 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01729 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01729 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01729 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01729 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01729 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01729 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01729 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01729 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01729 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01729 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01729 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01729 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01729 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01729 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01729 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01729 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01729 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01729 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01729 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01729 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01729 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01729 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01729 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01729 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01729 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01729 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01729 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01729 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01729 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01729 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01729 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01729 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01729 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01729 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01729 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01729 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01729 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01729 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01729 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01729 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01729 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01729 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms