Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01657 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01657 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01657 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01657 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01657 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01657 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P01657 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01657 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01657 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01657 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01657 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01657 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01657 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01657 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01657 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P01657 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01657 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01657 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01657 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P01657 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01657 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01657 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01657 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01657 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01657 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01657 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01657 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01657 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01657 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01657 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01657 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01657 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P01657 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01657 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01657 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01657 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
P01657 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
P01657 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01657 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01657 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01657 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01657 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01657 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01657 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01657 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01657 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01657 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01657 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01657 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01657 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01657 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01657 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01657 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01657 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P01657 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01657 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01657 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01657 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01657 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01657 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01657 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01657 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P01657 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
P01657 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P01657 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01657 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P01657 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01657 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P01657 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01657 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01657 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01657 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01657 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
P01657 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P01657 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P01657 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01657 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01657 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01657 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01657 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01657 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P01657 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P01657 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01657 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01657 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01657 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P01657 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01657 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
P01657 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P01657 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01657 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01657 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01657 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01657 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P01657 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
P01657 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01657 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01657 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P01657 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms