Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01629 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01629 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01629 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01629 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01629 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01629 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01629 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01629 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01629 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01629 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01629 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01629 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01629 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01629 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01629 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01629 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01629 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01629 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01629 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01629 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01629 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01629 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01629 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01629 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01629 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01629 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01629 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01629 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01629 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01629 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01629 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01629 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01629 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01629 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01629 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01629 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01629 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01629 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01629 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01629 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01629 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01629 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01629 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01629 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01629 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01629 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01629 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01629 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01629 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01629 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01629 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01629 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01629 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01629 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01629 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01629 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01629 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01629 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01629 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01629 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01629 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01629 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01629 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01629 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01629 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01629 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01629 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01629 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01629 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01629 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01629 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01629 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01629 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01629 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01629 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01629 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01629 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P01629 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P01629 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P01629 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01629 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01629 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01629 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01629 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01629 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01629 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01629 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01629 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01629 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01629 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms