Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

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Length 1,124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms