Protein–RNA interactions for Protein: O88909

Slc22a8, Solute carrier family 22 member 8, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a8O88909 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc22a8O88909 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a8O88909 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a8O88909 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a8O88909 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a8O88909 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a8O88909 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a8O88909 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms