Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RradO88667 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RradO88667 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RradO88667 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RradO88667 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RradO88667 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RradO88667 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RradO88667 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RradO88667 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RradO88667 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RradO88667 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RradO88667 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RradO88667 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RradO88667 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RradO88667 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RradO88667 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RradO88667 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RradO88667 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RradO88667 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RradO88667 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RradO88667 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RradO88667 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RradO88667 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RradO88667 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RradO88667 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RradO88667 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RradO88667 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RradO88667 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RradO88667 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RradO88667 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RradO88667 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RradO88667 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RradO88667 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RradO88667 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RradO88667 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RradO88667 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RradO88667 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RradO88667 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RradO88667 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RradO88667 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RradO88667 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RradO88667 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RradO88667 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RradO88667 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RradO88667 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RradO88667 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RradO88667 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RradO88667 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RradO88667 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RradO88667 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RradO88667 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RradO88667 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RradO88667 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RradO88667 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RradO88667 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RradO88667 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RradO88667 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RradO88667 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RradO88667 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RradO88667 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RradO88667 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RradO88667 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RradO88667 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RradO88667 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RradO88667 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RradO88667 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RradO88667 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RradO88667 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RradO88667 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RradO88667 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RradO88667 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RradO88667 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RradO88667 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RradO88667 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RradO88667 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RradO88667 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RradO88667 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RradO88667 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RradO88667 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RradO88667 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RradO88667 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RradO88667 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RradO88667 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RradO88667 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RradO88667 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RradO88667 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RradO88667 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RradO88667 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RradO88667 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RradO88667 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RradO88667 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RradO88667 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms