Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd7O88665 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brd7O88665 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd7O88665 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd7O88665 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd7O88665 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brd7O88665 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brd7O88665 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brd7O88665 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.1 ms