Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CntfrO88507 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CntfrO88507 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CntfrO88507 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CntfrO88507 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntfrO88507 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CntfrO88507 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CntfrO88507 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CntfrO88507 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CntfrO88507 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CntfrO88507 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfrO88507 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfrO88507 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CntfrO88507 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfrO88507 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CntfrO88507 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfrO88507 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfrO88507 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfrO88507 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfrO88507 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfrO88507 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfrO88507 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfrO88507 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfrO88507 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfrO88507 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CntfrO88507 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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