Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnk4O88454 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnk4O88454 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcnk4O88454 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnk4O88454 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnk4O88454 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms