Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vti1bO88384 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vti1bO88384 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vti1bO88384 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vti1bO88384 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vti1bO88384 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms