Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx12O70493 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx12O70493 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx12O70493 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx12O70493 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx12O70493 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx12O70493 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx12O70493 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx12O70493 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx12O70493 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx12O70493 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx12O70493 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx12O70493 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx12O70493 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx12O70493 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx12O70493 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms