Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx3O70492 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx3O70492 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx3O70492 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx3O70492 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx3O70492 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx3O70492 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx3O70492 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx3O70492 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx3O70492 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx3O70492 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx3O70492 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx3O70492 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx3O70492 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx3O70492 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx3O70492 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms