Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma3O70435 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma3O70435 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma3O70435 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma3O70435 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psma3O70435 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma3O70435 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psma3O70435 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psma3O70435 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma3O70435 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma3O70435 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psma3O70435 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psma3O70435 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma3O70435 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psma3O70435 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psma3O70435 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma3O70435 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma3O70435 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psma3O70435 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms