Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nipsnap2O55126 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nipsnap2O55126 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap2O55126 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap2O55126 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms