Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PrxO55103 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PrxO55103 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PrxO55103 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PrxO55103 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PrxO55103 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PrxO55103 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PrxO55103 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PrxO55103 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PrxO55103 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PrxO55103 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PrxO55103 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PrxO55103 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PrxO55103 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PrxO55103 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PrxO55103 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PrxO55103 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PrxO55103 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PrxO55103 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PrxO55103 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PrxO55103 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PrxO55103 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PrxO55103 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PrxO55103 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PrxO55103 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PrxO55103 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PrxO55103 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PrxO55103 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PrxO55103 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PrxO55103 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PrxO55103 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PrxO55103 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PrxO55103 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PrxO55103 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PrxO55103 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PrxO55103 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PrxO55103 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PrxO55103 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PrxO55103 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PrxO55103 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PrxO55103 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PrxO55103 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PrxO55103 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PrxO55103 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PrxO55103 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PrxO55103 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PrxO55103 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PrxO55103 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PrxO55103 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PrxO55103 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PrxO55103 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PrxO55103 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PrxO55103 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PrxO55103 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PrxO55103 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PrxO55103 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PrxO55103 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PrxO55103 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PrxO55103 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PrxO55103 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PrxO55103 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PrxO55103 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PrxO55103 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PrxO55103 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PrxO55103 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PrxO55103 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PrxO55103 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PrxO55103 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PrxO55103 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PrxO55103 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PrxO55103 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PrxO55103 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PrxO55103 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PrxO55103 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PrxO55103 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PrxO55103 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PrxO55103 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PrxO55103 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PrxO55103 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PrxO55103 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PrxO55103 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PrxO55103 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PrxO55103 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PrxO55103 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PrxO55103 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PrxO55103 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PrxO55103 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PrxO55103 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PrxO55103 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PrxO55103 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PrxO55103 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PrxO55103 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PrxO55103 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PrxO55103 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PrxO55103 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PrxO55103 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PrxO55103 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PrxO55103 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PrxO55103 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PrxO55103 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms