Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Bnip3O55003 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Bnip3O55003 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bnip3O55003 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Bnip3O55003 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms