Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccr6O54689 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccr6O54689 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccr6O54689 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccr6O54689 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms