Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bnc1O35914 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bnc1O35914 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Bnc1O35914 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bnc1O35914 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bnc1O35914 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms