Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18,31■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18,31■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18,31■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,3■□□□□ 0,52
Cited2O35740 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18,3■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18,28■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18,28■□□□□ 0,52
Cited2O35740 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18,28■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,28■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18,27■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18,27■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18,27■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
Cited2O35740 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,26■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Cited2O35740 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18,26■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,26■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,25■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18,24■□□□□ 0,51
Cited2O35740 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18,24■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Cited2O35740 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18,21■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18,21■□□□□ 0,51
Cited2O35740 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18,2■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18,18■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Cited2O35740 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18,17■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18,15■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Cited2O35740 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Cited2O35740 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18,12■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Cited2O35740 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18,12■□□□□ 0,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms