Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lhx8O35652 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lhx8O35652 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lhx8O35652 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lhx8O35652 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lhx8O35652 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx8O35652 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx8O35652 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx8O35652 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lhx8O35652 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx8O35652 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx8O35652 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lhx8O35652 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms