Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scamp3O35609 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scamp3O35609 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scamp3O35609 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scamp3O35609 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms