Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clk2O35491 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clk2O35491 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Clk2O35491 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clk2O35491 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clk2O35491 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clk2O35491 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clk2O35491 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clk2O35491 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clk2O35491 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clk2O35491 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clk2O35491 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clk2O35491 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clk2O35491 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clk2O35491 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Clk2O35491 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clk2O35491 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clk2O35491 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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